Skip to Main Content
It looks like you're using Internet Explorer 11 or older. This website works best with modern browsers such as the latest versions of Chrome, Firefox, Safari, and Edge. If you continue with this browser, you may see unexpected results.
Universiteitsbibliotheek – LibGuides

Referentiebeheer: Mendeley

Libguide Referentiebeheer, incl. EndNote, RefWorks, Mendeley en Zotero

Mendeley

Mendeley is een programma van Elsevier dat gratis gebruikt kan worden, maar ook een betaalde Premium versie heeft (niet in gebruik bij de Universiteit Utrecht). Het helpt je bij het verzamelen, organiseren, citeren en delen van verwijzingen (=referenties) naar - en vaak ook de full text van - bronnen (artikelen, boeken, data etc). 

Er bestaan een desktopversie en een (verouderde) webversie die onderling kunnen synchroniseren.
Sinds 2020 is er ook de Mendeley Reference Manager (voornamelijk online).
Bij zowel de web- als de desktopversie en de nieuwe Mendeley Reference Manager moet je je eerst registreren en bij die laatste twee moet je ook software downloaden. Een account bij Elsevier geldt voor alle Elsevier producten, zoals Mendeley, Scopus en ScienceDirect.

Mendeley is beschikbaar voor Windows 7 of nieuwer, Mac OS X 10-10 of nieuwer, Linux en Ubuntu/Debian. 
NB. De nieuwe Mendeley Reference Manager is niet compatibel met macOS 10.15.

 

Source:  https://youtu.be/5Mz02_xmLRs

Mendeley Support:

Algemeen 
https://elsevier.libguides.com/Mendeley
https://www.mendeley.com/guides
https://www.mendeley.com/guides/citation-guides
https://service.elsevier.com/app/home/supporthub/mendeley/
https://blog.mendeley.com/

Mendeley Desktop
https://www.mendeley.com/guides/desktop
https://www.mendeley.com/guides/desktop/01-desktop-interface 

Mendeley Reference Manager
https://www.mendeley.com/guides/mendeley-reference-manager
https://www.mendeley.com/guides/mendeley-reference-manager/01.-your-mendeley-library 

Mendeley Desktop

  • Als je het nog niet gedaan hebt, maak een gratis account aan (NB we hebben geen institutioneel account bij de UU, om problemen met het inloggen in Mendeley Desktop of Mendeley Reference Manager te voorkomen kun je het beste een account aanmaken met een privé mailadres en NIET met je UU mailadres). Als je je wachtwoord bent vergeten klik op 'Forgot password?' om te resetten.
  • UU-medewerker:
    Zie de informatie op het UU intranet (onder Referentiemanagement).
  • UMCU-medewerker:
    Als je Mendeley wilt installeren neem dan contact op met de UMCU Helpdesk. Zie de Informatie op het UMCU intranet. NB: the Mendeley Web Importer kan niet worden geïnstalleerd binnen de UMCU omgeving.
  • UU-student:
    Mendeley Desktop is beschikbaar via MyWorkplace.

     

  • Installeren op een eigen computer?
    Download de software om Mendeley desktop op je computer te installeren.
     
  • Installeer indien gewenst de Mendeley Web Importer (voor Chrome, Microsoft Edge en Firefox) in je browser en sleep/vind de button in je bookmarks/favorieten. Deze browserextensie scant je huidige browservenster op verwijzingen naar artikelen en haalt waar mogelijk metadata en full-text pdf's op om die toe te voegen aan je bibliotheek.  
  • Indien gewenst installeer ook de Citation plugin voor Word (Mendeley Cite).

Mendeley Web hoef je niet te installeren. Ga naar www.mendeley.com en log in bij Mendeley met behulp van de 'Sign in' button in de rechterbovenhoek.

Aan de slag:

Maak een of meerdere folders aan in Mendeley Desktop. Onder 'My Library' kies voor 'Create Folder'.
Handige startpagina voor Desktop: https://www.mendeley.com/guides/desktop/01-desktop-interface 

Voor meer informatie zie: 
https://www.mendeley.com/download-desktop-new/
https://www.mendeley.com/guides/web

https://www.mendeley.com/guides/download-mendeley-desktop/windows/instructions
https://www.mendeley.com/guides/download-mendeley-desktop/mac/instructions
https://www.mendeley.com/guides/download-mendeley-desktop/linux/instructions
https://www.mendeley.com/guides/download-mendeley-desktop/ubuntu/instructions

 

Mendeley Reference Manager 

  1. Als je het nog niet gedaan hebt, maak een gratis account aan (NB we hebben geen institutional account bij de UU)
  2. Download en installeer Mendeley Reference Manager
  3. Installeer indien gewenst de Mendeley Web Importer (zie hierboven) en de Citation plugin voor Word (Mendeley Cite)
  4. Open Reference Manager vervolgens hier: mendeley.com/reference-manager
Upgrade Mendeley Desktop library naar Mendeley Reference manager
  1. Zorg dat je bestaande Mendeley Desktop library gesynchroniseerd is
  2. Download en installeer Mendeley Reference Manager
  3. Log in met je Mendeley username en wachtwoord en je bestaande bibliotheek zal automatisch synchroniseren 

Aan de slag:
In Mendeley Reference Manager kies je onder 'Collections' voor 'New collection'.
Handige startpagina voor MRM: https://www.mendeley.com/guides/mendeley-reference-manager/01.-your-mendeley-library 

Voor meer informatie zie: 
https://www.mendeley.com/download-reference-manager/windows 
https://www.mendeley.com/download-reference-manager/macOS 
https://www.mendeley.com/download-reference-manager/linux

 

Tips & tricks

  • Mendeley Desktop heeft vooralsnog net iets meer mogelijkheden dan Mendeley Reference Manager. Gebruik Desktop voor het beheren van je bibliotheek en Reference Manager voor het online werken en synchroniseren in de cloud
  • Je kunt Mendeley Desktop  dus tegelijk met Mendeley Reference Manager gebruiken. Als je handmatig synchroniseert in Mendeley Desktop, zullen alle wijzigingen die je hebt aangebracht automatisch updaten in Mendeley Reference Manager. En omgekeerd: alle wijzigingen die je in Mendeley Reference Manager maakt worden automatisch gesynchroniseerd naar de cloud en worden zichtbaar in Mendeley Desktop nadat je daar een handmatige synchronisatie hebt uitgevoerd.
  • Voor je telefoon: download de gratis app voor iOS of Android uit je appstore

Mendeley biedt een aantal opties om referenties te verzamelen.

Mendeley Desktop
Je kunt documenten aan je Mendeley bibliotheek toevoegen door pdf's in je Mendeley omgeving te slepen (drag and drop files vanaf je computer).
Daarnaast is er de Add files optie en kun je handmatig referenties toevoegen.
https://www.mendeley.com/guides/desktop/02-adding-documents

Extra optie: de Mendeley Web Importer
Sla verwijzingen van internet rechtstreeks op in je Mendeley-bibliotheek met de Mendeley Web Importer. Deze browserextensie scant je huidige browservenster op verwijzingen naar artikelen en haalt waar mogelijk metadata en full-text pdf's op om die toe te voegen aan je bibliotheek.
https://www.mendeley.com/guides/web-importer

Elsevier optie: vanuit een zoeksysteem met Direct Export
Vanuit andere Elsevier producten, zoals Scopus en ScienceDirect, kun je via de Direct Export optie referenties importeren in Mendeley.

  1. Log in bij Mendeley voor je gaat zoeken
  2. Selecteer de titel(s) uit de resultatenlijst en klik op Export. Vervolgens kies je voor de optie Mendeley.

NB. Let goed op, lang niet altijd zal Mendeley alle gegevens (correct) vinden en toevoegen, dus kijk altijd je referenties na. Verbeter en vul aan waar nodig.
 

Mendeley Reference Manager
(Opties: 1. vanuit een andere al bestaande verzameling referenties importeren (bijvoorbeeld vanuit een andere reference tool); 2. voeg files toe vanaf je computer; 3. handmatig toevoegen)
https://www.mendeley.com/guides/mendeley-reference-manager/02.-adding-references

mendeley add files


Tips & tricks

  • Probeer eens de Mendeley Web Catalogue. Zoek m.b.v het zoekvenster op Mendeley.com en  klik 'Add to library' om gevonden referenties toe te voegen. Deze tool vult ontbrekende referentiegegevens aan, maar werkt minder goed bij relatief onbekende bronnen en kan dan zelfs verkeerde informatie toevoegen of gegevens overschrijven. Blijf dus altijd zelf controleren!
  • In Desktop kun je een DOI, PMID of ArXiv ID gebruiken om gegevens op te halen. Plak de identifier in het daartoe bestemde veld en klik op het vergrootglas. Het item wordt dan opgezocht in de Mendeley Catalogue en zal referentiegegevens van de titels ophalen bij andere Mendeley gebruikers. Als de referentie nieuw is zullen gegevens opgehaald worden bij de aanbieder van de identifier.
    Ook in Reference Manager kun je op die manier automatisch gegevens laten ophalen. Ga naar 'Add new', 'Add Manual Entry' en kopieer en plak de doi in het betreffende veld.
     
  • MendelManual

Let op! de gegevens kunnen incompleet of fout zijn, dus controleer altijd alle gegevens zelf!

Je kunt je bronnen in Mendeley op verschillende manieren organiseren en er informatie aan toevoegen. Zo kun je referenties een ster geven zodat ze in je 'Favorites' map komen of markeren als (niet-)gelezen. Je kunt ook zelf mappen aanmaken.
Als je een referentie toevoegt aan een nieuw gemaakte folder/collectie verplaats je hem niet, maar geef je de referentie een label. Alle referenties blijven in de folder ‘All References’ staan. Als je een folder/collectie verwijdert dan blijft de referentie beschikbaar in ‘All References’.

Mendeley Desktop
(gebruik van filters, folders en subfolders aanmaken, zoeken en tags toevoegen), 
https://www.mendeley.com/guides/desktop/03-organizing-documents
(de PDF reader met o.a. de opties: notities toevoegen, tekst markeren, inzoomen, synchroniseren)
https://www.mendeley.com/guides/desktop/04-read-highlight-annotate
 

Mendeley Reference Manager
(o.a. bestaande collecties en nieuwe collecties aanmaken en zoeken)
https://www.mendeley.com/guides/mendeley-reference-manager/03.-searching-and-organizing-references 
(o.a. selecteren, notities toevoegen, markeren, sticky notes toevoegen, inzoomen)
https://www.mendeley.com/guides/mendeley-reference-manager/04.-reading-and-annotating-documents

NB. Indien je de gegevens van een referentie wilt aanpassen klik dan op de betreffende titel en vervolgens op het aan te passen veld onder 'Info'.
edit authors in mendeley

 

In de PDF reader kun je documenten (pdf's) lezen en annoteren:

  • In Mendeley Desktop open je pdf's door op het PDF icoon te klikken, in Reference Manager klik je op het groene vinkje onder File.
    Bij beide systemen kan het ook door dubbel te klikken op de titel.  Het document opent in een aparte tab.

    mendeley pdf reader

    In de PDF reader kan je:
    • Zoeken in de tekst (gebruik de zoek box rechtsboven in de taakbalk) De gebruikte zoektermen worden gemarkeerd in de tekst
    • Tekstgedeelten markeren (highlight)
    • In Desktop: Je kunt notities over het gehele document toevoegen middels het veld  'General notes'
    • Je kunt 'Sticky notes' toevoegen aan specifieke passages in de tekst (annoteren). In de tekst worden sticky notes aangeduid met een icoontje. Klik erop om de notitie te lezen.
      • In Desktop: Alle notities kunnen bekeken worden in de 'Notes' tab (naast de 'Details' tab in de rechter kolom).
      • In Reference Manager: om alle sticky notes in de PDF  te zien selecteer de 'Info' button en kies voor de 'Annotations' tab.
      • Voor meer informatie  over 'share, export, or print annotations', zie deze blog post.

 

Tips & tricks

  • In Reference Manager: gebruik Mendeley Notebook om  highlights en notities van meerdere pdf's op een plek bij elkaar te bewaren. Je kunt het Notebook openen met de  knop 'Notebook' boven de PDF.

Mendeley Desktop

  • Selecteer in de linkerkolom de map  die je wilt ontdubbelen, dat kan de map 'All Documents' zijn, maar ook een zelfgemaakte map
  • Ga naar het Tools menu en kies voor 'Check for Duplicates' 
  • Je krijgt dan een lijst van dubbele items te zien
  • Klik op de titel die wilt ontdubbelen om de onderliggende dubbele referenties te bekijken (kies 'Details' in de rechter kolom)
  • Mendeley geeft aan welke velden van de oorspronkelijke titels zijn gekozen. Je kunt dit aanpassen door de checkbox naast elk veld aan of uit te vinken
  • Klik dan op 'Merge documents' om de referenties samen te voegen
  • Je kunt ook kiezen voor 'Not a duplicate' om allebei de referenties te behouden
  • Herhaal deze stappen voor al je dubbele titels

Let op: Mendeley kan automatisch titels ontdubbelen bij het importeren, zonder dat je dat in de gaten hebt of kunt controleren. Je kunt dit ook niet uitzetten. Je kunt hierdoor referenties kwijtraken die je wel had willen hebben. Om deze reden is Mendeley niet geschikt om te gebruiken bij een systematic review.

Voor meer informatie over ontdubbelen in Desktop zie:
https://blog.mendeley.com/tag/deduplication/ 
of bekijk deze video's:

Source: https://www.youtube.com/watch?v=BzREf4RJ25w

 

Source: https://www.youtube.com/watch?v=0-p2XHRm-UE

Mendeley Reference Manager
In Mendeley Reference Manager is geen aparte optie voor ontdubbelen.

Voor Mendeley Desktop: de Mendeley Citation Plugin
(zie ook Mendeley Cite hieronder)

Deze kun je installeren vanuit je Mendeley bibliotheek:

  1. Zorg dat Word uit staat
  2. Ga naar je Mendeley bibliotheek en open het Tools menu. Mendeley zal nu zelf aangeven welke word processor jij hebt, dus de gegeven opties kunnen varieren. Kies evt de optie die voor jou het meest van toepassing is.
  3. De installatie gaat heel snel en na afloop krijg je een bevestiging.
  4. Open nu Word en kijk onder de knop Referenties/References, daar zie je nu een setje tools voor Mendeley:

Mendeley Cite in Word

NB. Bij Libre Office of Microsoft Word for Mac ziet het er net iets anders uit.

Voor meer informatie over de Mendeley Citation Plugin zie de help guide, bijvoorbeeld over:

Voor Mendeley Reference Manager: Mendeley Cite

Installeer Mendeley Cite voor Word (en Libre Office).
Voor meer informatie over Mendeley Cite zie de help guide, bijvoorbeeld over:

NB. Je kunt Mendeley Cite ook gebruiken met Mendeley Desktop zolang je een ondersteunde versie van Microsoft Word gebruikt en je Mendeley Library gesynchroniseerd is in de cloud.

Documenten delen met anderen en  samenwerken in groepen kan in 'private groups'. Iedereen kan onbeperkt aan private groups deelnemen, maar als gratis gebruiker mag je er maar max. 5 aanmaken met max. 25 deelnemers.

Je kunt de full text van je pdf toevoegen aan een de groep zodat iedereen met en in hetzelfde document werkt. Iedereen kan dan de tekst highlighten en notities toevoegen.

Private groups voor Desktop
https://www.mendeley.com/guides/private-groups/mendeley-desktop/01-adding-documents-private-group

Private groups voor Mendeley Reference Manager
https://www.mendeley.com/guides/private-groups/mendeley-reference-manager/01-adding-documents-private-group

N.B. soms is er in handleidingen nog sprake van Public Groups en Invite-only groups. Die bestaan echter niet meer sinds april 2020.

Mendeley Desktop

Als je online werkt  wordt Mendeley Desktop volledig gesynchroniseerd met Mendeley Web. Je referenties worden dan opgeslagen in de cloud. Je kunt ook handmatig synchroniseren via het Sync icoontje in Mendeley Desktop. Notes en annotations die gemaakt zijn in een groep komen dan ook beschikbaar voor de andere deelnemers.
Let op! Je lokaal opgeslagen data kan qua omvang groter zijn dan je gratis opslag mogelijkheden in de cloud!

Zie ook: https://www.mendeley.com/guides/desktop/07-how-sync-works

Als je (ook) regelmatig offline werkt of als je zeker wilt zijn dat je bibliotheek veilig is bij een onverwachte calamiteit, is het verstandig om regelmatig een backup te maken van je Mendeley bibliotheek. Ook als je van account wisselt moet je eerst een backup maken.
Ga hiervoor naar het Help menu en klik op Create Backup. Je maakt dan een .zip file die je kunt opslaan op een veilige plek op je computer

Mendeley back up

Om je backup terug te zetten, kies in het Help menu voor Restore backup en vervolgens voor Other. Browse dan naar je (meest recente) opgeslagen zip file.

Zie ook: https://service.elsevier.com/app/answers/detail/a_id/18153/p/16075/supporthub/mendeley/related/1/

NB. Je kunt Mendeley Desktop tegelijk met Mendeley Reference Manager gebruiken. Als je handmatig synchroniseert in Mendeley Desktop, zullen alle wijzigingen die je hebt aangebracht automatisch updaten in Mendeley Reference Manager. En omgekeerd: alle wijzigingen die je in Mendeley Reference Manager maakt worden automatisch gesynchroniseerd naar de cloud en worden zichtbaar in Mendeley Desktop nadat je daar handmatig hebt gesynchroniseerd.

Exporteren

Je kunt je referenties ook exporteren naar een bestand.  Je kunt dit bestand later (of in een ander programma) weer importeren. 
Voor instructies ga naar: Mendeley Desktop of: Mendeley Reference manager.

Mendeley Reference Manager

Mendeley Reference Manager slaat al je referenties op in de cloud (dus niet lokaal op je computer). Als je online bent wordt er automatisch gesynchroniseerd en worden alle aanpassingen die je hebt gemaakt opgeslagen. Houd je cursor boven het sync icoontje om te zien wanneer er voor het laatst is gesynchroniseerd of klik op het icoontje om handmatig te synchroniseren.

Zie ook: https://www.mendeley.com/guides/mendeley-reference-manager/07.-syncing

Let op! Het is mogelijk om offline handmatig referenties toe te voegen in MRM. Zorg er dan wel voor dat je regelmatig online werkt om te synchroniseren met de cloud.

Het offline gebruik van Mendeley Reference Manager kent wel een aantal bekende problemen. Lukt het bij jou niet, kijk dan eens hier: https://service.elsevier.com/app/answers/detail/a_id/29758/supporthub/mendeley/p/16075/