Skip to main content
Universiteitsbibliotheek – LibGuides

Literatuuronderzoek Biologie: PubMed

Even opletten!

Voor probleemloos doorklikken ook thuis via de Universiteitsbibliotheek naar PubMed!

  • MeSH- termen
  • Automatic Term mapping - Search details
  • Specifieke filters

MeSH termen

Elke referentie in PubMed wordt - op basis van de inhoud - voorzien van ‘MeSH-termen’ (Medical Subject Headings). Dit toekennen van  internationaal afgesproken trefwoorden heet ‘indexeren'

De toegekende MeSH-termen zijn een belangrijk hulpmiddel om literatuur op onderwerp te kunnen vinden, ongeacht de taal waarin ze zijn geschreven; ook niet-engelstalige publicaties worden zo makkelijk vindbaar.

Welke MeSH termen er aan een artikel zijn toegekend kun je zelf controleren; klik op de titel en kijk onderaan:

  • Bij artikelen die al wel geïndexeerd zijn (de meeste) staat: [PubMed - indexed for MEDLINE], plus een ‘pull-out’ menu

Als je dit menu uitklapt (op de dubbele pijltjes helemaal rechts klikken), krijg je te zien wélke MeSH-termen aan dit artikel zijn toegekend.

  • Bij artikelen die nog niet voorzien zijn van MeSH (heel recente artikelen!) staat: [PubMed – as supplied by publisher] of [PubMed - in process]

Automatic Term Mapping

De door jou ingetypte zoektermen 'vertaalt' PubMed waar mogelijk automatisch in MeSH-termen. Dit wordt Automatic Term Mapping genoemd.

Vervolgens zoekt PubMed:

(a) in het veld 'MeSH terms' van elke publicatie; met de betreffende MeSH-term

(b) in ‘All Fields': met de MeSH-term én met de letterlijk ingevoerde zoekterm

Screenshot search details 'aids'

Wat PubMed precies heeft gedaan met de door jou ingevoerde zoektermen kun je zien onder ‘Search details‘, in de rechterkolom van het resultatenscherm:

De vertaling van zoektermen door PubMed is niet altijd logisch en consistent. Kijk dus altijd onder ‘Search details’ en pas de zoekactie desgewenst aan.

Filters - het beperken van het aantal zoekresultaten

Soms / vaak krijg je ondanks het gebruik van goede zoektermen toch te veel treffers... Dan kun je via filters je zoekactie verder inperken.

In de resultatenlijst zie je in de linkerzijbalk een aantal filters die je aan kunt klikken.

Je kunt nu bijvoorbeeld instellen dat PubMed alleen zoekt binnen bepaalde soorten publicaties, of binnen een bepaalde tijdsperiode, of alleen naar artikelen die gaan over non-humans.

Via de optie ‘Show additional filters‘ zijn nog meer filters beschikbaar, bv. voor leeftijdsgroep (‘Ages‘) en bepaalde groepen tijdschriften (‘Journal categories‘):

 

 

Wees voorzichtig met het gebruik van filters: je krijgt al snel een te sterke inperking van je zoekresultaten. Bovendien verlies je in veel gevallen de recente, nog niet geïndexeerde artikelen. Dit komt doordat de meeste filters (behalve die voor taal en publicatiedatum !) gebaseerd zijn op MeSH-termen.

Let op: Eenmaal ingestelde filters blijven gelden voor alle volgende zoekacties, totdat je ze verwijdert.

Zoeken in PubMed

is een zoekmachine voor de database MEDLINE. Deze bevat meer dan 24 miljoen biomedische referenties. Hiermee kun je in één keer ruim 5600 biomedische tijdschriften uit 80 landen doorzoeken.

Hoe haal je het beste uit PubMed? Doe de Training PubMed UBU LibGuide Training PubMed: deze is ontwikkeld voor 3e-jaars studenten geneeskunde in het UMC Utrecht, maar ook héél geschikt voor studenten diergeneeskunde.